Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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