Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms