Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp30Q3UN04 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms