Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CrxosQ3UL53 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms