Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms