Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gse1Q3U3C9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gse1Q3U3C9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms