Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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