Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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