Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms