Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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