Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccndbp1Q3TVC7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccndbp1Q3TVC7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccndbp1Q3TVC7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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