Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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