Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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