Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms