Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax1Q2NKI2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms