Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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