Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cd300lgQ1ERP8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms