Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc162pQ0VG85 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms