Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntnap5cQ0V8T7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms