Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Cnn1Q08091 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cnn1Q08091 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms