Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms