Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.1 ms