Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gjb5Q02739 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms