Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms