Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms