Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms