Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp1Q00915 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms