Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms