Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms