Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmsP97355 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmsP97355 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms