Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tp53bp1P70399 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tp53bp1P70399 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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