Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms