Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms