Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbdsP70122 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbdsP70122 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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