Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Acta1P68134 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Acta1P68134 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Acta1P68134 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Acta1P68134 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Acta1P68134 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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