Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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