Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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