Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl27P61358 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms