Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2kP61087 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms