Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P58686 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P58686 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P58686 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P58686 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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P58686 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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P58686 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P58686 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P58686 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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