Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms