Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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