Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Edn3P48299 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms