Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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