Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms