Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms