Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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