Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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