Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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