Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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